Home Arrow Icon Knowledge base Arrow Icon Global Arrow Icon Aké sú rozdiely v podpore formátu súborov medzi Fionou a Pyogrio


Aké sú rozdiely v podpore formátu súborov medzi Fionou a Pyogrio


Fiona a Pyogrio sú knižnice používané na čítanie a zápis formátov priestorových vektorových údajov. Aj keď zdieľajú niektoré podobnosti, existujú kľúčové rozdiely v ich prístupoch a schopnostiach:

1. Prístup

- Fiona: Fiona je plnohodnotná knižnica Python na prácu s vektorovými zdrojmi údajov OGR. Používa stavový prístup, kde sa údaje čítajú alebo zapisujú v sérii prechodov, čo umožňuje väčšiu flexibilitu a kontrolu nad spracovaním údajov. Vďaka tomu je vhodný pre širokú škálu úloh vrátane zložitých transformácií údajov a prírastkových zápisov alebo pripájaní[1].
- Pyogrio: Pyogrio je experimentálny prístup, ktorý využíva vektorizovaný prístup (orientovaný na pole) na čítanie a zápis priestorových vektorových formátov súborov. Interne používa prístup orientovaný na numpy v Cythone na čítanie informácií o zdrojoch údajov a záznamoch z vrstiev priestorových údajov. Tento prístup umožňuje rýchlejšie I/O operácie, ale môže byť menej flexibilný ako Fiona kvôli svojej bezstavovej povahe, kde sa všetky dáta čítajú alebo zapisujú v jednom prechode[1].

2. Podpora formátov súborov

- Fiona: Fiona podporuje širokú škálu formátov súborov vrátane ESRI Shapefile, GeoPackage, GeoJSON a mnohých ďalších. Je to univerzálna I/O knižnica priestorového formátu používaná v mnohých projektoch v ekosystéme Python[1].
- Pyogrio: Pyogrio sa špecificky zameriava na GeoPandas ako pokus o zníženie počtu transformácií údajov potrebných na čítanie/zápis údajov medzi GeoPandas GeoDataFrames a formátmi priestorových súborov pomocou Fiona. Podporuje formáty GeoJSON, GeoPackage a Shapefile, ale primárne sa zameriava na I/O operácie orientované na GeoPandas[1][5].

3. Výkon

- Fiona: Fiona je známa svojou flexibilitou a robustnosťou, ale nemusí byť optimalizovaná pre výkon. Je navrhnutý tak, aby zvládal zložité transformácie údajov a podporuje prírastkové zápisy alebo pripájania.
- Pyogrio: Pyogrio je navrhnutý pre rýchlejšie I/O operácie využívajúce vektorizovaný prístup. To môže viesť k výraznému zlepšeniu výkonu v porovnaní s Fionou, najmä pri veľkých súboroch údajov[1].

4. Inštalácia a kompatibilita

- Fiona: Fiona je široko dostupná a podporuje širšiu škálu platforiem vrátane Windows. Štandardne je súčasťou GeoPandas a môže byť použitý ako motor na čítanie a zapisovanie súborov.
- Pyogrio: Pyogrio je k dispozícii na Conda-forge pre Linux a MacOS, ale zatiaľ nie na PyPi kvôli zložitosti binárnych závislostí balenia pre Windows. Vyžaduje kompatibilné verzie GDAL a numpy od Conda-forge pre podporu surových I/O a geopandy, pygeos a ich závislosti pre podporu I/O GeoDataFrame[1].

5. Predvolený engine v GeoPandas

- Fiona: Fiona je v súčasnosti predvoleným nástrojom, ktorý GeoPandas používa na čítanie a zápis súborov. GeoPandas 1.0 však prejde na používanie Pyogrio ako predvoleného motora kvôli jeho potenciálu pre výrazné zrýchlenie[4].

Stručne povedané, Fiona ponúka väčšiu flexibilitu a kontrolu nad spracovaním údajov, zatiaľ čo Pyogrio je optimalizované pre rýchlejšie I/O operácie. Fiona podporuje širšiu škálu formátov súborov a je dostupnejšia, ale Pyogrio je navrhnutý špeciálne pre I/O operácie orientované na GeoPandas a môže poskytnúť vylepšenia výkonu.

Citácie:
[1] https://pypi.org/project/pyogrio/0.2.0/
[2] https://github.com/geopandas/geopandas/issues/2908
[3] https://discourse.pangeo.io/t/geopandas-bbox-and-mask-params-return-empty-dataframe-fiona-pyogrio-for-file-geodatabase/3011
[4] https://geopandas.org/en/stable/docs/reference/api/geopandas.read_file.html
[5] https://github.com/geopandas/pyogrio